技术笔记共8篇

R画图y轴范围太大时,如何局部压缩坐标轴?

R画图y轴范围太大时,如何局部压缩坐标轴?-赵煮机

用 R 画图的时候,如果 y 轴存在个别非常大或非常小的值,或者当中的数值存在非常大差异的时候,画出的图很容易产生误导效果,使人忽略当中某一部分信息。 比如,下面这张 GWAS 曼哈顿图中(来...

# R

3月21日 19:21
0470

R读取大文件速度太慢?来试试能提速两千倍的fread

R读取大文件速度太慢?来试试能提速两千倍的fread-赵煮机

R 的 read.table 和 read.csv 读取文件速度比较慢。尤其在读取稍微大一点的数据,需要等很长时间。 在需要读取大文件时,尤其读取列数特别多的文件,不妨试试 data.table 包(https://cran.r-...

# R# R语言

1月28日 19:21
01340

Anaconda安装升级软件包总是失败,试试用国内镜像源

Anaconda安装升级软件包总是失败,试试用国内镜像源-赵煮机

在国内连接 Anaconda 官方源速度非常慢。用官方源去安装、升级包,速度估计会抓狂,说不定还总是失败。 解决方法很简单,只需要把官方镜像替换为国内的镜像。网上搜的教程一般是清华或者中科...

# Python# Anaconda

10月29日 18:59
03530

Python创建大量线程时遇上OpenBLAS blas_thread_init报错怎么办?

Python创建大量线程时遇上OpenBLAS blas_thread_init报错怎么办?-赵煮机

计算机明明还有空闲资源,但 Python 创建大量线程时,遇上OpenBLAS blas_thread_init报错怎么办? 具体看看着报错信息: OpenBLAS blas_thread_init: RLIMIT_NPROC 4096 current, 8251551 max...

# Python

9月2日 21:47
08100

预算有限怎么办?来看看这篇千元级别的生信服务器搭建指南

预算有限怎么办?来看看这篇千元级别的生信服务器搭建指南-赵煮机

做生信分析的人越来越多,但并不是每个人都有足够的计算资源。云计算是个好东西,但它的成本优势更多体现在大数据处理上,每天需要处理几十几百 TB 甚至 PB 级别的数据时,云计算才会比自建维护...

# 教程# 生物信息学# 服务器

7月11日 18:57
06650

嫌Python太慢但又不想学C/C++?来了解下JIT技术

嫌Python太慢但又不想学C/C++?来了解下JIT技术-赵煮机

什么是 JIT Python 是门多才多艺的语言,既可以写后端,也可以做数据分析,既可以智能化运维,也可以搞渗透,既可以写爬虫,又可以做机器学习深度学习。然而,Python 的缺点也很明显,它的速度...

# Python# 科学计算# JIT

7月5日 15:38
04840

年轻人的第一台服务器:最低不到五千,捡垃圾搭建自己的科学计算平台

年轻人的第一台服务器:最低不到五千,捡垃圾搭建自己的科学计算平台-赵煮机

开篇三问 Q:有什么需求? A:跑耗资源的科学运算。 Q:为什么捡垃圾? A:因为穷。 Q:怎么捡垃圾? A:全能的淘宝。 三个开篇问题,算是写这篇剁手文章的借口理由。普通 PC 很难支撑得起...

# 服务器

6月1日 09:36
011730

Linux无root权限通过Anaconda虚拟环境安装R并在Jupyter Lab运行

Linux无root权限通过Anaconda虚拟环境安装R并在Jupyter Lab运行-赵煮机

一般情况下,R 的安装非常容易。但如果是在linux服务器上,而又没有root权限,安装就比较麻烦了。最直接的方法是自己在有读写权限的目录中编译安装,但过程非常繁琐,需要解决非常多依赖库,整...

# R# Anaconda

5月31日 21:45
08110