GWAS_Flow:使用GPU加速大规模数据的全基因组关联分析

21世纪是生物的世纪,生物数据的增长速度越来越快。很多分析工具在开发时并没有考虑到大规模数据的应用场景。在数据量不大的时候,这些工具的计算时间并不会太长,可以让人接受。但在数据规模...
一键查看后端程序语言,分析网站技术栈

当看到一个网站,想要了解它用了什么技术开发,可以通过开发者工具去看,但这样的效率很低。下面推荐两个方便的工具: W3tech https://w3techs.com Bu...
日本人群的大规模GWAS发现多种疾病的新型易感基因座

文献信息 标题: Large-scale genome-wide association study in a Japanese population identifies no...
使用Python版XP-CLR检测基因组中的选择信号

上一篇文章 《使用XP-CLR检测基因组中的选择信号》 介绍了 XP-CLR。XP-CLR 是一种是基于选择扫荡(selective sweeep)的似然方法。选择扫荡可以增加群体...
使用XP-CLR检测基因组中的选择信号

检测基因组选择信号的方法有很多种,其中 XP-CLR 方法是常用的一种。XP-CLR 是陈华老师、Nick Patterson 和 David Reich 在 2010 年发表的方...
年轻人的第一台服务器:最低不到五千,捡垃圾搭建自己的科学计算平台

开篇三问 Q:有什么需求? A:跑耗资源的科学运算。 Q:为什么捡垃圾? A:因为穷。 Q:怎么捡垃圾? A:全能的淘宝。 三个开篇问题,算是写这篇剁手文章的借口理由。普通...
炼丹入门必备:迈向调参之路的新手指南(深度学习篇)

选定学习路线 上回介绍了机器学习的入门指南,这一次轮到更为火爆的深度学习。深度学习有非常多免费的优质课程,不用花钱就能在家享受名师教学的体验。这一次,也主要是介绍免费的资料。 ...
炼丹入门必备:迈向调参之路的新手指南(机器学习篇)

避免成为资料收藏家 机器学习越来越火爆,各种资料也越来越多。在网上随意一搜,就能看到一大串长长的书单和一大堆视频教程。堆积如山的资料,很容易让新手一脸懵逼,无所适从,最后没当成炼...
Linux无root权限通过Anaconda虚拟环境安装R并在Jupyter Lab运行

一般情况下,R 的安装非常容易。但如果是在linux服务器上,而又没有root权限,安装就比较麻烦了。最直接的方法是自己在有读写权限的目录中编译安装,但过程非常繁琐,需要解决非常多...
face3d: 3D人脸处理Python开源工具

简介 3D 人脸是非常有趣的研究领域。face3D (https://github.com/YadiraF/face3d) 是一个基于 Python 的开源项目,实现了 3D 人...
精打细算,域名比价网站大全

不同域名注册商的注册价格还是有不少差别的。本着一分钱也是钱的精打细算精神,下面推荐几个域名比价网站。 Tld-list https://zh-hans.tld-list.com...
Docker快速部署GitLab搭建私人仓库

黑五抢了个Virmach的大内存机器,终于可以折腾下超级吃内存的GitLab。GitLab的安装方式有好几种,个人比较建议用Docker,部署快速,而且不容易影响机器本身安装好的服...