全基因组关联分析共3篇

基于RAINBOW的单倍型全基因组关联分析(haplotype-based GWAS)教程-赵煮机

基于RAINBOW的单倍型全基因组关联分析(haplotype-based GWAS)教程

听起来难以置信,单倍型关联分析竟然这么简单 Haplotype-based GWAS(单倍型全基因组关联分析)是基于 haplotype (单倍型)进行的关联分析,在基因组层面寻找与表型相关的变异。 Haplotype...
1月24日 20:22
03810
CAUSALdb:涵盖数千个GWAS研究和Fine-mapping结果的可视化数据库-赵煮机

CAUSALdb:涵盖数千个GWAS研究和Fine-mapping结果的可视化数据库

现在 GWAS 研究越来越多。要查询以往的 GWAS 研究结果,可以使用 GWAS Catalog。GWAS Catalog 包含的信息非常多,不过有时可能满足不了需要。这里,推荐一个叫 CAUSALdb 的数据库。 CAUSALdb(...
7月7日 16:51
08630
GWAS_Flow:使用GPU加速大规模数据的全基因组关联分析-赵煮机

GWAS_Flow:使用GPU加速大规模数据的全基因组关联分析

21世纪是生物的世纪,生物数据的增长速度越来越快。很多分析工具在开发时并没有考虑到大规模数据的应用场景。在数据量不大的时候,这些工具的计算时间并不会太长,可以让人接受。但在数据规模庞...
6月20日 12:51
08700