基因组学共5篇

使用ADMIXTURE估计个体的祖先成分

使用ADMIXTURE估计个体的祖先成分-赵煮机

ADMIXTURE 是常用的群体遗传学分析工具,可以估计个体的祖先成分。与 STRUCTURE 相比,它的速度更快。它的下载地址是 http://dalexander.github.io/admixture/download.html,下载解压就可以使...

生物信息# 教程# 生物信息学# 群体遗传

7月26日 22:59
010850

使用Hapbin基于EHH、iHS、XP-EHH方法检测基因组中的选择信号

使用Hapbin基于EHH、iHS、XP-EHH方法检测基因组中的选择信号-赵煮机

EHH(Extended Haplotype Homozygosity)、iHS(Integrated Haplotype Score) 和 XP-EHH(Cross Population Extended Haplotype Homozogysity)是常用的基于 haplotype 分析基因组受选择情况的...

生物信息# 教程# 生物信息学# 群体遗传

7月19日 18:06
012960

FINEMAP:使用GWAS摘要数据进行无功能注释数据的精细定位(Fine-mapping)

FINEMAP:使用GWAS摘要数据进行无功能注释数据的精细定位(Fine-mapping)-赵煮机

介绍 全基因组关联分析(GWAS)是非常流行的定位表型或疾病遗传位点方法。不过很多情况下,GWAS 发现的最显著的 SNP(top SNP 或者 index SNP)并不是真正造成影响的causal SNP(因果SNP),而...

生物信息# 教程# 生物信息学# GWAS

7月9日 09:48
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CAUSALdb:涵盖数千个GWAS研究和Fine-mapping结果的可视化数据库

CAUSALdb:涵盖数千个GWAS研究和Fine-mapping结果的可视化数据库-赵煮机

现在 GWAS 研究越来越多。要查询以往的 GWAS 研究结果,可以使用 GWAS Catalog。GWAS Catalog 包含的信息非常多,不过有时可能满足不了需要。这里,推荐一个叫 CAUSALdb 的数据库。 CAUSALdb(...

生物信息# 生物信息学# GWAS# 基因组学

7月7日 16:51
06290

日本人群的大规模GWAS发现多种疾病的新型易感基因座

日本人群的大规模GWAS发现多种疾病的新型易感基因座-赵煮机

文献信息 标题: Large-scale genome-wide association study in a Japanese population identifies novel susceptibility loci across different diseases 中文标题: 日本人群的大规模全基...

文献速读# GWAS# 群体遗传# 基因组学

6月9日 21:15
08630