教程共8篇

使用ADMIXTURE估计个体的祖先成分

使用ADMIXTURE估计个体的祖先成分-赵煮机

ADMIXTURE 是常用的群体遗传学分析工具,可以估计个体的祖先成分。与 STRUCTURE 相比,它的速度更快。 下面介绍一下它的使用。STRUCTURE 可以输入 Plin...

生物信息# 教程# 生物信息学# 基因组学

7月26日 22:59
02920

使用Hapbin基于EHH、iHS、XP-EHH方法检测基因组中的选择信号

使用Hapbin基于EHH、iHS、XP-EHH方法检测基因组中的选择信号-赵煮机

EHH(Extended Haplotype Homozygosity)、iHS(Integrated Haplotype Score) 和 XP-EHH(Cross Popula...

生物信息# 教程# 生物信息学# 基因组学

7月19日 18:06
04320

预算有限怎么办?来看看这篇千元级别的生信服务器搭建指南

预算有限怎么办?来看看这篇千元级别的生信服务器搭建指南-赵煮机

做生信分析的人越来越多,但并不是每个人都有足够的计算资源。云计算是个好东西,但它的成本优势更多体现在大数据处理上,每天需要处理几十几百 TB 甚至 PB 级别的数据时,云计算才会比...

技术笔记# 教程# 生物信息学# 服务器

7月11日 18:57
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FINEMAP:使用GWAS摘要数据进行无功能注释数据的精细定位(Fine-mapping)

FINEMAP:使用GWAS摘要数据进行无功能注释数据的精细定位(Fine-mapping)-赵煮机

介绍 全基因组关联分析(GWAS)是非常流行的定位表型或疾病遗传位点方法。不过很多情况下,GWAS 发现的最显著的 SNP(top SNP 或者 index SNP)并不是真正造...

生物信息# 教程# 生物信息学# 基因组学

7月9日 09:48
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使用Python版XP-CLR检测基因组中的选择信号

使用Python版XP-CLR检测基因组中的选择信号-赵煮机

上一篇文章 《使用XP-CLR检测基因组中的选择信号》 介绍了 XP-CLR。XP-CLR 是一种是基于选择扫荡(selective sweeep)的似然方法。选择扫荡可以增加群体...

生物信息# 教程# 生物信息学# 自然选择

6月7日 18:05
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使用XP-CLR检测基因组中的选择信号

使用XP-CLR检测基因组中的选择信号-赵煮机

检测基因组选择信号的方法有很多种,其中 XP-CLR 方法是常用的一种。XP-CLR 是陈华老师、Nick Patterson 和 David Reich 在 2010 年发表的方...

生物信息# 教程# 生物信息学# 自然选择

6月2日 18:20
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Docker快速部署GitLab搭建私人仓库

Docker快速部署GitLab搭建私人仓库-赵煮机

黑五抢了个Virmach的大内存机器,终于可以折腾下超级吃内存的GitLab。GitLab的安装方式有好几种,个人比较建议用Docker,部署快速,而且不容易影响机器本身安装好的服...

折腾玩机# 教程# Docker# GitLab

11月27日 22:26
020470

如何挂PT: CentOS 7安装配置美化Transmission

如何挂PT: CentOS 7安装配置美化Transmission-赵煮机

安装 Transmission包含在EPEL拓展仓库中,如果没有安装EPEL源,安装前需要输入以下命令安装EPEL源(需要root权限): yum -y install epe...

折腾玩机# 教程# PT

4月9日 21:57
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