PCA方法校正群体结构，GWAS该用多少个主成分？
该选择多少个主成分 群体结构（population structure），或者说群体分层（population stratification），是由于个体之间非随机交配而导致的群体中亚群之间等位基因频率的系统差异。这种系统差...
史前化石揭示狗的起源和群体历史
狗是第一个被驯化的动物，可能起源于与人类发生了密切接触的灰狼。不过，狗的起源仍有很多争议。虽然已经有不少这方面的研究，但绝大部分研究是基于现代的狗和灰狼进行溯祖，有些问题依旧未能解...
使用ADMIXTURE估计个体的祖先成分
ADMIXTURE 是常用的群体遗传学分析工具，可以估计个体的祖先成分。与 STRUCTURE 相比，它的速度更快。它的下载地址是 http://dalexander.github.io/admixture/download.html，下载解压就可以使...
使用Hapbin基于EHH、iHS、XP-EHH方法检测基因组中的选择信号
EHH（Extended Haplotype Homozygosity）、iHS（Integrated Haplotype Score） 和 XP-EHH（Cross Population Extended Haplotype Homozogysity）是常用的基于 haplotype 分析基因组受选择情况的...
日本人群的大规模GWAS发现多种疾病的新型易感基因座
文献信息 标题： Large-scale genome-wide association study in a Japanese population identifies novel susceptibility loci across different diseases 中文标题： 日本人群的大规模全基...
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