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使用ADMIXTURE估计个体的祖先成分

生物信息 0条评论 2020-7-26 54 views
ADMIXTURE 是常用的群体遗传学分析工具,可以估计个体的祖先成分。与 STRUCTURE 相比,它的速度更快。下面介绍一下它的使用。STRUCTURE 可以输入 Plink 或者 EIGENSTRAT 格式的数据,这里以 plink 格式的文件为例。筛选SNPSNP 数量太多,计算会非常慢。可

使用Hapbin基于EHH、iHS、XP-EHH方法检测基因组中的选择信号

生物信息 0条评论 2020-7-19 98 views
EHH(Extended Haplotype Homozygosity)、iHS(Integrated Haplotype Score) 和 XP-EHH(Cross Population Extended Haplotype Homozogysity)是常用的基于 haplotype 分析基因组受

日本人群的大规模GWAS发现多种疾病的新型易感基因座

文献速读 0条评论 2020-6-9 181 views
文献信息标题: Large-scale genome-wide association study in a Japanese population identifies novel susceptibility loci across different diseases中文标题: 日本人群的大规