当前位置： 首页 > Tag Archives: 自然选择
使用Hapbin基于EHH、iHS、XP-EHH方法检测基因组中的选择信号
0条评论 2020-7-19
EHH（Extended Haplotype Homozygosity）、iHS（Integrated Haplotype Score） 和 XP-EHH（Cross Population Extended Haplotype Homozogysity）是常用的基于 haplotype 分析基因组受
使用Python版XP-CLR检测基因组中的选择信号
0条评论 2020-6-7
上一篇文章 《使用XP-CLR检测基因组中的选择信号》 介绍了 XP-CLR。XP-CLR 是一种是基于选择扫荡（selective sweeep）的似然方法。选择扫荡可以增加群体之间的遗传分化，导致等位基因频率偏离中性条件下的预期值。XP-CLR 利用了两个群体之间的多基因座等位基因频率差异（mu
使用XP-CLR检测基因组中的选择信号
0条评论 2020-6-2
检测基因组选择信号的方法有很多种，其中 XP-CLR 方法是常用的一种。XP-CLR 是陈华老师、Nick Patterson 和 David Reich 在 2010 年发表的方法，全称叫 the cross-population composite likelihood ratio test（跨
